目录格式对知网查重的影响主要有两个方面：一是目录的规范性，二是目录的完整性。首先，规范的目录格式能够让知网系统更好地识别和比对论文内容，提高查重的准确性。其次，完整的目录能够确保整篇论文内容都被纳入查重范围，避免遗漏部分内容导致查重结果不准确。

目录格式影响知网查重的原因主要在于目录作为论文结构的重要组成部分，直接影响了知网系统对论文内容的识别和比对。如果目录格式混乱或不规范，会导致知网系统无法准确地识别论文内容，从而影响查重结果的准确性。因此，作者在准备论文时应当注意规范目录格式，确保目录清晰完整，有利于知网系统准确查重。